분자 시뮬레이션과 그에 필요한 이론들에 대해 탐구하였다. 이를 바탕으로 하여 분자 시뮬레이션이 적용된 실제 연구 사례를 분석하고, 향후 응용 분야에 대한 고찰을 하였다. 또한, 분자 시뮬레이션으로 계산 가능한 물리량과 실험 결과와의 차이를 이해하는 탐구를 진행하였다. 전체적인 탐구 내용과 배경 지식을 바탕으로 하여 시스템을 직접 설계하고, 적절한 Force Field를 선택하여 시뮬레이션으로 물리적 특성을 예측하는 탐구를 진행하였다.